一年一度的七夕行将到来，东京、神奈、静冈、长野等地却接连产生六起连环杀人案，被害者身边皆留下麻将牌中的七筒和希奇暗示。因为作案局限过大，各地警署捕快纷繁聚到东京警署的专案组配合研讨案情，毛利小五郎也被邀请加入，柯南则偷偷听取了会议的内容。会后，柯南偶尔入耳到群马县警部山村操哼唱的儿歌，继而发明有黑衣构造的成员混进警察中央。在一次围捕行动中，柯南遇到假扮人质的Vermouth，得知近期连续串的杀人案件与存有构造内部职员资料的记忆卡有关。与此同时，潜入警察内部的间谍偷偷窃取工藤新一和柯南的指纹，新一的身份眼看被拆穿，庞大的危险正向他和身边的人急速袭来……
