经由长时候的休整，治疗眼伤的濑文焚流（加濑亮 饰）终究随着当麻（户田惠梨香 饰）重返阔别已久的未详，只是此时来自公安部公安五课的市柳（でんでん 饰）和吉川（北村一辉 饰）握得实权，令濑文等人颇为气闷。与此同时，在街市商人算命的觉被一把握刹时移动才能的黑衣男人射杀，同时遇害的还有觉的保镖以及几名无辜市民。怙恃双双遇害而作为幸存者而且目击了黑衣人真实容颜的少女长了望（谷村美月 饰）便成为对方追杀的方针。为了珍爱小望，未详同仁共同努力，并延续追索黑衣人的真面目以及其背后的阴谋。在此时代，当麻也展示了其不为人知的SPEC。一场斗智斗勇的战役拉开了序幕……
